CTO · MateBio
GraphRAG para Startup TechBio
Lideré la transformación de datos crudos de un knowledge graph biomédico en una plataforma escalable, defendible y comercialmente viable. MateBio ofrece herramientas con AI que permiten a investigadores de laboratorio en empresas de biotech y pharma explorar relaciones biológicas complejas mediante consultas en lenguaje natural y visualizaciones interactivas.
- Diseñe la arquitectura de un agente LLM multi-tool que convierte preguntas biomédicas en lenguaje natural en consultas Cypher validadas sobre un knowledge graph en Neo4j que integra más de 80 fuentes de datos, con reconocimiento de entidades, trazabilidad de procedencia y puntuación de confianza.
- Construí un motor híbrido de resolución de entidades que mapea términos imprecisos ("p53", "cáncer de mama") a identificadores exactos del grafo, combinando NER biomédico heurístico, búsqueda full-text y vectorial por tipo, y desambiguación con un modelo chico.
- Sumé una capa de analítica de biología de sistemas: centralidad con Graph Data Science (PageRank y personalized PageRank sobre proyecciones pre-computadas) más un servicio de cohortes de EHR sintético que genera "Spoke signatures" para rankear genes y vías a partir de cohortes clínicas.
- Construí ingesta de datos multimodal para que los investigadores pudieran sumar sus propios datos junto al grafo: RAG de documentos PDF y URL, más análisis de CSV y ómicas con diagramas mermaid generados automáticamente.
- Desplegué la plataforma en dos nubes (AWS y GCP, cada una con Neo4j y PostgreSQL) con CI/CD en Terraform, migraciones de base de datos automáticas y un camino de migración cross-cloud probado.